大多数慢性脂肪肝预后良好，如果能早期诊断，可以阻止脂肪肝的进一步发展，甚至使其逆转，肥胖，糖尿病，高血脂症等引起的脂肪肝多为隐匿性起病，病程相对较长，即使已发生脂肪型肝炎和肝纤维化，如果能有效控制体重和维持血脂，血糖与正常水平，肝脏病变仍有可能完全消退。
病毒型肝炎病发脂肪肝时，其预后基本上取决于肝炎本身的进程。虽然长期的肝内脂肪蓄积可能促进肝纤维化，但因肝内脂肪本身不是主要致病因素，且经过治疗可吸收消散，故对预后无明显影响。
酒精性脂肪肝如果能坚持解救，则预后良好。但是如果继续饮酒，可经肝纤维化或酒精性肝炎而发展为肝硬化。
